亲子鉴定是遗传统计学理论在法医学中的一个典型应用。亲子鉴定是基于亲代和子代的遗传标记的基因分型信息（如STR位点），通过统计学中的似然比检验思想，推测争议父与孩子间是否具有亲缘关系的一种方法。常用于亲子鉴定的统计指标为亲权指数和平均非父排除率。在亲子鉴定报告中，一般同时报告这两个指标，以便综合评判检验结果 。
一、鉴定原因
进行亲子鉴定的主要原因：随着科技的发展，加上传统的家庭观念的改变，使得现代生物科技水平和需求不谋而合。由于自由化和人们对性别关系的开放，伦理的轻视，人生的生活方式等变化，导致许多夫妻结婚后都担心孩子不是自己的，大部分是丈夫怀疑孩子不是亲生，还有的是怀孕前不止与一个人有过性关系的女性，她们为了搞清孩子的亲生父亲是谁，怀着孕就提出鉴定。
司法亲子鉴定
遗产继承纠纷要确定是否亲生；
强奸犯的认定；
认领被拐卖儿童；
未婚先育落户，超生落户、无法提供出生证明；
遇难者（空难、海啸等）身份无法辨认；
抚养权纠纷。
1、司法鉴定只能适用于诉讼活动，是在特定的诉讼审判程序过程中，由法官启动的一项科学鉴定活动。换言之，不参与诉讼活动的，也就是不在法庭打官司，就不需要做司法亲子鉴定；需要打官司，诉讼到法院后，由法院启动的鉴定，才叫司法鉴定。
2、司法鉴定活动必须遵循诉讼法及有关司法解释进行，程序违法的鉴定结论不能成为鉴定材料。
司法亲子鉴定是指需要把鉴定报告提供给法院、公安机关、公证处以及出入境管理处等司法机构的一种鉴定，司法亲子鉴定报告具有法律效力，可以作为证据使用。
个人亲子鉴定
怀疑子女不是亲生；
怀疑医院产房或育婴室调换新生儿；
失散的家庭成员认亲；
亲子鉴定还包括：亲缘鉴定（父系或母系），移民鉴定等。
1、个人亲子鉴定本身就是不公开的，所以鉴定委托人有权不提供任何证件。样本可以自行取样，送到专业鉴定机构，其鉴定结果仅提供给鉴定委托人。鉴定结果可以作为民事诉讼中的证据。
2、司法亲子鉴定是完全公开的，必须鉴定委托人父、母、孩子三方同意，面对面到场，带齐相关有效证件包括身份证、户口本等。鉴定结果可以用做司法用途（上户口、办移民、打官司等），也可以作为法庭上的呈堂证供。
个体识别鉴定
一般用于刑事案件，鉴定DNA信息是否同属于一人。
二、司法亲子鉴定特点：
司法亲子鉴定的受理程序相对严谨，以确保鉴定结果的准确、真实、公正、有效。
（1）被鉴定人必须亲自来本中心办理实名委托；
（2）被鉴定人必须提供本人真实有效的身份证件；
（3）被鉴定人必须承诺提供的信息真实有效；
（4）我鉴定中心认真核对被鉴定人身份信息并现场拍照；
（5）亲子鉴定样本必须由本中心工作人员采集，必要时须有公证人员在场。.
三、亲缘关系鉴定
遗传学理论已证实，子女的基因组DNA各有一半分别来源于亲生父母一方。法医物证专业开展的亲缘关系鉴定包括以下几类：
1．常规的亲生血缘关系鉴定：这是需求量最大的一类亲权关系鉴定，包括父母子三方（又称为三联体）、父子（或母子）双方（又称为二联体）的亲权鉴定。这类鉴定的准确率可以达到99.999999%。
2．隔代亲缘关系鉴定：这类鉴定指要确认曾祖父母与曾孙子（曾孙女）、祖父母与孙子（孙女）之间的亲缘关系。还包括单纯的父系亲缘关系鉴定如要确认曾祖父与曾孙子、祖父与孙子之间的亲缘关系，以及单纯的母系亲缘关系鉴定如要确认曾祖母与曾外孙女、外祖母与外孙女之间的亲缘关系。
3．疑难的亲缘关系鉴定：除上述两类外，还有一些比较疑难的亲缘关系鉴定，如父母皆疑（无）的同胞（兄弟、兄妹、姐弟、姐妹）、表兄妹关系的鉴定，叔侄之间、姨和外甥女之间、舅舅与外甥（外甥女）之间的亲缘关系鉴定等。
四、鉴定原理
判定亲生关系的理论依据是孟德尔遗传的分离律。按照这一规律，在配子细胞形成时，成对的等位基因彼此分离，分别进入各自的配子细胞。精、卵细胞受精形成子代，孩子的两个基因组一个来自母亲，一个来自父亲；因此同对的等位基因也就是一个来自母亲，一个来自父亲。鉴定结果如果符合该规律，则不排除亲生关系，若不符合，则排除亲生关系（变异情况除外）。在大多数的情况下，母、子关系是已知的，要求鉴定假设父和孩子是否亲生关系。此时首先从母、子基因型的对比中，可以确定孩子基因中可能来自父亲的基因（生父基因，OG）。然后观察假设父亲的基因型，如果不具有生父基因，则可排除假设父与孩子的亲生关系。若假设父也具有生父基因，结果就不能排除假设父的亲生关系，假设某案例中母亲是FGA-22/23型，孩子为22/25型，从比较中可确定生父基因是FGA-25。此案中假设父1为FGA-22/24型；假设父2为24/25型。其中假设父1不具备生父基因25，故可排除他与孩子的亲生关系；相比之下，假设父2因具有FGA-25，不排除与孩子有亲生关系。
五、鉴定步骤
DNA亲子鉴定实验操作步骤如下：
第一步：DNA提取
把样本细胞核中所含有DNA提取出来，然后进行一定的纯化，化除样本中的杂质。
第二步：PCR扩增
PCR的中文名为聚合酶链式反应，简单的说，PCR扩增这一步就是把我们所需要的片段通过酶促反应，在PCR仪上进行大量复制，放大到通过某些专用仪器可以看到的程度。
第三步：后PCR反应
这一步主要是上ABI测序仪检测的准备阶段，将双链的DNA打开，加一些检测用的的内标，主要是用来标记检测的片段长度。
第四步：毛细管测序仪检测
由于DNA带有电荷，通过毛细管电泳的方法，不同片段DNA长度的电泳速度不同，在同样的电压，同样的电泳时间下，泳动的距离不同，这些长短不同距离可以通过前期加入的内标测量分辨出来，同时可通过一定的软件显示在电脑上，方便检测人员处理和分析数据。
第五步：分析数据，出具报告
主要是检测人员将所得结果进行分析汇总、计算，然后出鉴定结论和报告。
